Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SRSF6Q13247 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms