Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SEMA3BQ13214 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3BQ13214 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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SEMA3BQ13214 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SEMA3BQ13214 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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