Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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