Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
RESTQ13127 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
RESTQ13127 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms