Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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