Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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