Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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