Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIN2AQ12879 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIN2AQ12879 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms