Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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