Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
STX4Q12846 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
STX4Q12846 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
STX4Q12846 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
STX4Q12846 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms