Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PGGT1BP53609 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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