Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
TTPAP49638 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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