Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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PTPRDP23468 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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