Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms