Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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