Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1BQ9UPS6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms