Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT23Q9C075 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT23Q9C075 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms