Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R3Q9BXE9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms