Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGAP1Q96PV0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms