Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK5RAP3Q96JB5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms