Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDC3Q96F86 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms