Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Stx18Q8VDS8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx18Q8VDS8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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