Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C9orf47Q6ZRZ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms