Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC141Q6ZP82 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms