Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF1Q3BBV0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF1Q3BBV0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms