Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNRD1Q16881 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNRD1Q16881 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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