Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FSCN1Q16658 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms