Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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COL4A6Q14031 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL4A6Q14031 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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