Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN3Q13064 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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