Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-1Q07627 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms