Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rcn1Q05186 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcn1Q05186 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms