Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms