Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTCFP49711 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTCFP49711 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTCFP49711 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTCFP49711 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTCFP49711 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTCFP49711 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTCFP49711 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTCFP49711 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTCFP49711 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTCFP49711 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms