Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1P21675 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1P21675 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1P21675 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1P21675 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1P21675 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1P21675 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1P21675 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF1P21675 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF1P21675 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms