Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF3P18847 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF3P18847 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF3P18847 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF3P18847 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF3P18847 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms