Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APBA3O96018 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms