Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPHP4O75161 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHP4O75161 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms