Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN3BO60391 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms