Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C9orf170A2RU37 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf170A2RU37 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms