Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
DDB1Q16531 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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