Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK5Q16478 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms