Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SNCBQ16143 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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SNCBQ16143 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SNCBQ16143 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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