Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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