Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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CNN3Q15417 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNN3Q15417 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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