Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HERC3Q15034 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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