Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERPUD1Q15011 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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