Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NEDD9Q14511 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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