Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
COL4A6Q14031 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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COL4A6Q14031 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL4A6Q14031 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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