Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1CQ13936 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms