Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GTF2H2Q13888 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms